Protein–RNA interactions for Protein: Q06219

Nr4a2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a2Q06219 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr4a2Q06219 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nr4a2Q06219 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr4a2Q06219 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms