Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox9Q04887 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox9Q04887 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox9Q04887 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox9Q04887 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms