Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox8Q04886 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox8Q04886 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sox8Q04886 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sox8Q04886 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sox8Q04886 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms