Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnd1Q03719 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kcnd1Q03719 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcnd1Q03719 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kcnd1Q03719 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms