Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk7Q03147 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdk7Q03147 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk7Q03147 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms