Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RykQ01887 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RykQ01887 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RykQ01887 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RykQ01887 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RykQ01887 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RykQ01887 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RykQ01887 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RykQ01887 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RykQ01887 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RykQ01887 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RykQ01887 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RykQ01887 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RykQ01887 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RykQ01887 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RykQ01887 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RykQ01887 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RykQ01887 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RykQ01887 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RykQ01887 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RykQ01887 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RykQ01887 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RykQ01887 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RykQ01887 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RykQ01887 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RykQ01887 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RykQ01887 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RykQ01887 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RykQ01887 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RykQ01887 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RykQ01887 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RykQ01887 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RykQ01887 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RykQ01887 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RykQ01887 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RykQ01887 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RykQ01887 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RykQ01887 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RykQ01887 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RykQ01887 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RykQ01887 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RykQ01887 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RykQ01887 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RykQ01887 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RykQ01887 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RykQ01887 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RykQ01887 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RykQ01887 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RykQ01887 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RykQ01887 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RykQ01887 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RykQ01887 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RykQ01887 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RykQ01887 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RykQ01887 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RykQ01887 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RykQ01887 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RykQ01887 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RykQ01887 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RykQ01887 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RykQ01887 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RykQ01887 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RykQ01887 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RykQ01887 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RykQ01887 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RykQ01887 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RykQ01887 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RykQ01887 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RykQ01887 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RykQ01887 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RykQ01887 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RykQ01887 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RykQ01887 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RykQ01887 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RykQ01887 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RykQ01887 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RykQ01887 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RykQ01887 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RykQ01887 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RykQ01887 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RykQ01887 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RykQ01887 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RykQ01887 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RykQ01887 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RykQ01887 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RykQ01887 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RykQ01887 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RykQ01887 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RykQ01887 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RykQ01887 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RykQ01887 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RykQ01887 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RykQ01887 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RykQ01887 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RykQ01887 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RykQ01887 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RykQ01887 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RykQ01887 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RykQ01887 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RykQ01887 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.8 ms