Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EgfrQ01279 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EgfrQ01279 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EgfrQ01279 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EgfrQ01279 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms