Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Col1a2Q01149 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col1a2Q01149 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col1a2Q01149 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col1a2Q01149 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms