Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig3P97386 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lig3P97386 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig3P97386 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lig3P97386 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig3P97386 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lig3P97386 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig3P97386 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lig3P97386 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lig3P97386 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig3P97386 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms