Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vgll3P85442 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vgll3P85442 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vgll3P85442 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Vgll3P85442 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms