Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gjb6P70689 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb6P70689 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb6P70689 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms