Protein–RNA interactions for Protein: P70434

Irf7, Interferon regulatory factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf7P70434 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf7P70434 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf7P70434 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf7P70434 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf7P70434 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf7P70434 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf7P70434 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf7P70434 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf7P70434 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf7P70434 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms