Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad1P70340 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad1P70340 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad1P70340 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smad1P70340 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad1P70340 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad1P70340 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad1P70340 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad1P70340 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smad1P70340 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad1P70340 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad1P70340 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad1P70340 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad1P70340 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad1P70340 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad1P70340 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad1P70340 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad1P70340 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad1P70340 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad1P70340 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smad1P70340 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad1P70340 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad1P70340 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad1P70340 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad1P70340 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smad1P70340 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms