Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NficP70255 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NficP70255 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NficP70255 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NficP70255 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NficP70255 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NficP70255 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NficP70255 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NficP70255 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NficP70255 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NficP70255 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NficP70255 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NficP70255 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NficP70255 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NficP70255 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NficP70255 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NficP70255 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NficP70255 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NficP70255 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NficP70255 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NficP70255 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NficP70255 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NficP70255 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NficP70255 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NficP70255 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NficP70255 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NficP70255 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NficP70255 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NficP70255 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NficP70255 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NficP70255 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NficP70255 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NficP70255 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NficP70255 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NficP70255 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NficP70255 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NficP70255 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NficP70255 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NficP70255 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NficP70255 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NficP70255 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NficP70255 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NficP70255 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NficP70255 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NficP70255 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NficP70255 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NficP70255 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NficP70255 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NficP70255 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NficP70255 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NficP70255 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NficP70255 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NficP70255 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NficP70255 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NficP70255 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NficP70255 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NficP70255 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NficP70255 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NficP70255 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NficP70255 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NficP70255 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NficP70255 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NficP70255 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NficP70255 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NficP70255 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NficP70255 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NficP70255 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NficP70255 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NficP70255 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NficP70255 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NficP70255 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NficP70255 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NficP70255 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NficP70255 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NficP70255 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NficP70255 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NficP70255 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NficP70255 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NficP70255 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NficP70255 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NficP70255 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NficP70255 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NficP70255 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NficP70255 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NficP70255 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NficP70255 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NficP70255 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NficP70255 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NficP70255 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NficP70255 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NficP70255 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NficP70255 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NficP70255 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NficP70255 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NficP70255 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NficP70255 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NficP70255 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NficP70255 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NficP70255 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NficP70255 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms