Protein–RNA interactions for Protein: P68037

Ube2l3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2l3P68037 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2l3P68037 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2l3P68037 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2l3P68037 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2l3P68037 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2l3P68037 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2l3P68037 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2l3P68037 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2l3P68037 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2l3P68037 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2l3P68037 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2l3P68037 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ube2l3P68037 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ube2l3P68037 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms