Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl23aP62751 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl23aP62751 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms