Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhobP62746 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhobP62746 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhobP62746 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhobP62746 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhobP62746 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhobP62746 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhobP62746 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RhobP62746 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RhobP62746 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhobP62746 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhobP62746 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhobP62746 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhobP62746 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhobP62746 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhobP62746 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhobP62746 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhobP62746 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhobP62746 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhobP62746 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhobP62746 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhobP62746 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhobP62746 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhobP62746 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhobP62746 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhobP62746 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhobP62746 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhobP62746 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhobP62746 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RhobP62746 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhobP62746 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhobP62746 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhobP62746 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhobP62746 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhobP62746 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhobP62746 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhobP62746 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhobP62746 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhobP62746 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhobP62746 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RhobP62746 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhobP62746 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhobP62746 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhobP62746 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhobP62746 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhobP62746 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhobP62746 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhobP62746 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhobP62746 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhobP62746 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhobP62746 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhobP62746 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhobP62746 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhobP62746 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhobP62746 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhobP62746 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhobP62746 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhobP62746 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhobP62746 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhobP62746 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhobP62746 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhobP62746 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhobP62746 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RhobP62746 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RhobP62746 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhobP62746 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhobP62746 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhobP62746 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhobP62746 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhobP62746 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhobP62746 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhobP62746 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhobP62746 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhobP62746 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhobP62746 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhobP62746 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhobP62746 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhobP62746 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RhobP62746 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhobP62746 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhobP62746 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RhobP62746 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhobP62746 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhobP62746 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhobP62746 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhobP62746 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhobP62746 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RhobP62746 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RhobP62746 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhobP62746 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhobP62746 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RhobP62746 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhobP62746 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhobP62746 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhobP62746 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RhobP62746 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RhobP62746 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhobP62746 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RhobP62746 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RhobP62746 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms