Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc6P62334 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc6P62334 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc6P62334 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc6P62334 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms