Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ufm1P61961 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ufm1P61961 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ufm1P61961 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms