Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actr1aP61164 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actr1aP61164 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actr1aP61164 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms