Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d3P61079 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ube2d3P61079 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d3P61079 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.9 ms