Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ActbP60710 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ActbP60710 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ActbP60710 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ActbP60710 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ActbP60710 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ActbP60710 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ActbP60710 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ActbP60710 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ActbP60710 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ActbP60710 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ActbP60710 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ActbP60710 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ActbP60710 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ActbP60710 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ActbP60710 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ActbP60710 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ActbP60710 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ActbP60710 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ActbP60710 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ActbP60710 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ActbP60710 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ActbP60710 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ActbP60710 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ActbP60710 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ActbP60710 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ActbP60710 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ActbP60710 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ActbP60710 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ActbP60710 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ActbP60710 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ActbP60710 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ActbP60710 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ActbP60710 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ActbP60710 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ActbP60710 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ActbP60710 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ActbP60710 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ActbP60710 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ActbP60710 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ActbP60710 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ActbP60710 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ActbP60710 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ActbP60710 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ActbP60710 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ActbP60710 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ActbP60710 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ActbP60710 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ActbP60710 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ActbP60710 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ActbP60710 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ActbP60710 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ActbP60710 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ActbP60710 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ActbP60710 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ActbP60710 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ActbP60710 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ActbP60710 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ActbP60710 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ActbP60710 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ActbP60710 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ActbP60710 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ActbP60710 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ActbP60710 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ActbP60710 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ActbP60710 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ActbP60710 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ActbP60710 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ActbP60710 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ActbP60710 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ActbP60710 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ActbP60710 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ActbP60710 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ActbP60710 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ActbP60710 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ActbP60710 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ActbP60710 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ActbP60710 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ActbP60710 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ActbP60710 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ActbP60710 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ActbP60710 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ActbP60710 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ActbP60710 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ActbP60710 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ActbP60710 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ActbP60710 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ActbP60710 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ActbP60710 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ActbP60710 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ActbP60710 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ActbP60710 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ActbP60710 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ActbP60710 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ActbP60710 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ActbP60710 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ActbP60710 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ActbP60710 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ActbP60710 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ActbP60710 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms