Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scarf2P59222 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scarf2P59222 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scarf2P59222 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms