Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox17P56394 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cox17P56394 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox17P56394 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox17P56394 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox17P56394 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox17P56394 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox17P56394 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox17P56394 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox17P56394 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox17P56394 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.8 ms