Protein–RNA interactions for Protein: P56384

Atp5g3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5g3P56384 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp5g3P56384 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp5g3P56384 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp5g3P56384 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp5g3P56384 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5g3P56384 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5g3P56384 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5g3P56384 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5g3P56384 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5g3P56384 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5g3P56384 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5g3P56384 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5g3P56384 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp5g3P56384 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp5g3P56384 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms