Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab2aP53994 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab2aP53994 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab2aP53994 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms