Protein–RNA interactions for Protein: P53986

Slc16a1, Monocarboxylate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a1P53986 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc16a1P53986 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc16a1P53986 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc16a1P53986 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc16a1P53986 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms