Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx1P52955 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx1P52955 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx1P52955 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx1P52955 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx1P52955 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx1P52955 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lbx1P52955 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lbx1P52955 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lbx1P52955 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lbx1P52955 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lbx1P52955 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lbx1P52955 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lbx1P52955 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lbx1P52955 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lbx1P52955 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lbx1P52955 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lbx1P52955 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lbx1P52955 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lbx1P52955 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lbx1P52955 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lbx1P52955 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lbx1P52955 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lbx1P52955 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms