Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp10P52479 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp10P52479 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp10P52479 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp10P52479 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp10P52479 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp10P52479 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp10P52479 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp10P52479 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp10P52479 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp10P52479 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp10P52479 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp10P52479 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp10P52479 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms