Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClgnP52194 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ClgnP52194 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClgnP52194 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClgnP52194 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ClgnP52194 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClgnP52194 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ClgnP52194 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClgnP52194 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ClgnP52194 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ClgnP52194 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClgnP52194 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms