Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc13P50207 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxc13P50207 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxc13P50207 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms