Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnni3P48787 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3P48787 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnni3P48787 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnni3P48787 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms