Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VdrP48281 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VdrP48281 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VdrP48281 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VdrP48281 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VdrP48281 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VdrP48281 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VdrP48281 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VdrP48281 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VdrP48281 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VdrP48281 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VdrP48281 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VdrP48281 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VdrP48281 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VdrP48281 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VdrP48281 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VdrP48281 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VdrP48281 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VdrP48281 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VdrP48281 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VdrP48281 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VdrP48281 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VdrP48281 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VdrP48281 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VdrP48281 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VdrP48281 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VdrP48281 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VdrP48281 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VdrP48281 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VdrP48281 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VdrP48281 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VdrP48281 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VdrP48281 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VdrP48281 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VdrP48281 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VdrP48281 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VdrP48281 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VdrP48281 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VdrP48281 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VdrP48281 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VdrP48281 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VdrP48281 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VdrP48281 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VdrP48281 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VdrP48281 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VdrP48281 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VdrP48281 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VdrP48281 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VdrP48281 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VdrP48281 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VdrP48281 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VdrP48281 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VdrP48281 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VdrP48281 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VdrP48281 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VdrP48281 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VdrP48281 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VdrP48281 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VdrP48281 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VdrP48281 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VdrP48281 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VdrP48281 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VdrP48281 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VdrP48281 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VdrP48281 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VdrP48281 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VdrP48281 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VdrP48281 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VdrP48281 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VdrP48281 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VdrP48281 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VdrP48281 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VdrP48281 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VdrP48281 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VdrP48281 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VdrP48281 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VdrP48281 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VdrP48281 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VdrP48281 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VdrP48281 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VdrP48281 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VdrP48281 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VdrP48281 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VdrP48281 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VdrP48281 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VdrP48281 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VdrP48281 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VdrP48281 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VdrP48281 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VdrP48281 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VdrP48281 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VdrP48281 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VdrP48281 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VdrP48281 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VdrP48281 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VdrP48281 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VdrP48281 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VdrP48281 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VdrP48281 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VdrP48281 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms