Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlx1P43345 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlx1P43345 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tlx1P43345 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms