Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clec3bP43025 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clec3bP43025 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clec3bP43025 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms