Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sept1P42209 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sept1P42209 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sept1P42209 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Sept1P42209 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sept1P42209 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sept1P42209 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sept1P42209 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sept1P42209 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sept1P42209 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sept1P42209 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms