Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pbx1P41778 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pbx1P41778 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pbx1P41778 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pbx1P41778 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pbx1P41778 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms