Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lig1P37913 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lig1P37913 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lig1P37913 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lig1P37913 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lig1P37913 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lig1P37913 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lig1P37913 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lig1P37913 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lig1P37913 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lig1P37913 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lig1P37913 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lig1P37913 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lig1P37913 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lig1P37913 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms