Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nedd1P33215 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nedd1P33215 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nedd1P33215 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nedd1P33215 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms