Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk4P30285 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk4P30285 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk4P30285 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk4P30285 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms