Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mmp3P28862 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp3P28862 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp3P28862 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp3P28862 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms