Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Aco1P28271 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Aco1P28271 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Aco1P28271 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aco1P28271 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aco1P28271 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aco1P28271 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Aco1P28271 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Aco1P28271 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Aco1P28271 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Aco1P28271 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Aco1P28271 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Aco1P28271 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aco1P28271 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aco1P28271 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aco1P28271 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Aco1P28271 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Aco1P28271 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms