Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vav1P27870 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vav1P27870 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vav1P27870 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vav1P27870 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vav1P27870 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vav1P27870 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vav1P27870 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vav1P27870 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vav1P27870 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vav1P27870 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vav1P27870 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vav1P27870 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vav1P27870 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vav1P27870 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vav1P27870 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav1P27870 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav1P27870 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav1P27870 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav1P27870 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav1P27870 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Vav1P27870 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vav1P27870 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms