Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmo2P25801 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmo2P25801 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms