Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd247P24161 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd247P24161 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd247P24161 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd247P24161 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd247P24161 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd247P24161 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd247P24161 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd247P24161 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd247P24161 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd247P24161 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd247P24161 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd247P24161 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd247P24161 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms