Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gja1P23242 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja1P23242 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gja1P23242 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gja1P23242 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja1P23242 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja1P23242 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja1P23242 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja1P23242 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja1P23242 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gja1P23242 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gja1P23242 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms