Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd3eP22646 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd3eP22646 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd3eP22646 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd3eP22646 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd3eP22646 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.3 ms