Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Myo5bP21271 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Myo5bP21271 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myo5bP21271 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Myo5bP21271 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Myo5bP21271 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Myo5bP21271 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Myo5bP21271 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo5bP21271 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo5bP21271 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo5bP21271 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo5bP21271 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo5bP21271 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo5bP21271 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Myo5bP21271 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Myo5bP21271 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms