Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PrkcaP20444 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcaP20444 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PrkcaP20444 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PrkcaP20444 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms