Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csn1s1P19228 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csn1s1P19228 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Csn1s1P19228 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Csn1s1P19228 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms